يحكي فيلم "ماء العين" قصة عائشة، أم تونسية، تحمي ابنها مهدي بشكل أعمى. عندما يعود إلى منزله بعد انخراطه في تنظيم الدولة الإسلامية برفقة زوجة غامضة، يصل حب عائشة الأمومي إلى أقصى الحدود. تتزامن عودة مهدي مع سلسلة من حالات الاختفاء الغريبة في قريتهم المعزولة.